La UCI es la unidad operativa encargada de apoyar la administración de los proyectos que se adjudique la Universidad, en el marco del Programa MECESUP2, permitiendo una adecuada comunicación con el Programa, en aspectos relativos al avance, cumplimiento de resultados y evaluación de impacto del proyecto así como también en los aspectos relativos a adquisiciones, finanzas y jurídicos asociados.

Para ello, la UCI cuenta con un Coordinador Institucional, y Encargados de: Evaluación y Seguimiento, Finanzas, Adquisiciones, Jurídico y de Contraloría Interna.