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Desarrollando su quehacer académico, la Facultad trabaja líneas de investigación en las áreas de Estructuras, Ingeniería Vial, Tecnologías y Procesos Constructivos, Materiales, Agentes Inteligentes en Robótica, Instrumentación Inteligente, entre otras. Como parte del interés de la Facultad en aplicar nuevas herramientas para mejorar las metodologías de aprendizaje de sus alumnos, en el año 2005 implementó el innovador proyecto "Comunidades de Aprendizaje", el cual es una tendencia mundial en el mejoramiento de la educación. Las Comunidades de Aprendizaje son un estilo para aprender, que relacionan y contextualizan contenidos, permitiendo prácticas de aprendizaje efectivas de estudiantes y profesores, a través de estrategias fundadas en la relación entre los dominios emocional, corporal y lingüístico. En el 2008, se acreditan por segunda vez los programas de Ingeniería Civil en Computación e Informática, junto a su plan de Prosecución de Estudios, y la carrera Ingeniería Civil en Obras Civiles. Asimismo, se acreditó la carrera de Ingeniería en Construcción junto a su plan de Programas Especiales. Acorde con sus prácticas de innovación, en el año 2006 la Facultad implementó el Magíster en Seguridad Informática y Protección de la Información, primer programa de este tipo en Chile. A partir del 2008, se incorporan el Doctorado en Ciencias Ambientales y el Magíster en Gestión de la Construcción, postgrados que vienen a reafirmar la solidez académica de la Facultad. Además, la Facultad dicta un Doctorado en Ingeniería en Computación y cuenta con planes vespertinos de Prosecución de estudios a Ingeniería Civil en Computación e Informática e Ingeniería Civil Industrial y con los Programas especiales de Ingeniería en Construcción
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La Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas da inicio a sus actividades en el año 1983. Actualmente cuenta con 6 carreras: Ingeniería Civil en Computación e Informática, Ingeniería Civil Industrial, Ingeniería Civil en Obras Civiles, Ingeniería en Construcción, Ingeniería en Computación e Ingeniería de Ejecución en Computación.